I Chamorros, gli abitanti originari di Guam, non usavano bandiere, né fu creata alcuna bandiera guamaniana mentre Guam era governata dalla Spagna (1521–1898). Guam passò sotto l'amministrazione statunitense in seguito alla guerra ispano-americana del 1898 e ottenne formalmente lo status di territorio nel 1950. L'ingresso degli Stati Uniti nella prima guerra mondiale ispirò Helen L. Paul, la moglie di un ufficiale della marina statunitense di stanza a Guam, a progettare un bandiera. Assomigliava a molte bandiere di stato degli Stati Uniti in quanto aveva un emblema (creato anche da Paul) centrato su un campo blu. La forma dell'emblema ricorda le pietre della fionda un tempo usate dai Chamorros per la caccia e lo sport. La scena mostra la foce del fiume Hagåtña (Agana) con una palma da cocco in primo piano. Two Lovers 'Leap, la scogliera sullo sfondo, ricorda una storia tradizionale. Una forma di canoa a bilanciere precedentemente in uso completa il progetto.
Questa bandiera fu ufficialmente adottata dal governo territoriale il 4 luglio 1917 e fu riconfermata il 12 maggio 1931. Le forze giapponesi occuparono Guam per quasi tre anni durante la seconda guerra mondiale. In commemorazione delle difficoltà sopportate in quel periodo, il 9 febbraio 1948 fu aggiunto un bordo rosso alla bandiera.
